以後当寺は三井家の祈願所として三井家の庇護の下にあり、境内は東西三十間、南北五十五間余五反七畝ありました。

　明治5年、神仏分離令と廃仏毀釈のため本殿等は壊され、前述の七保天満宮も廃止され成願寺の拝殿、社殿は北野御旅所へ移されました。

　昭和6年、日修上人は宗祖六百五十遠忌にその本堂を拡張し前後五十年間住職されました。戦後三井家の援助もなく荒廃しつつあるのを現住になって墓地の拡張、ガレージ事業等により又檀家の協力もあり書院の増築、屋根の総葺替、庫梩、風呂、便所の改造等整備し、昭和55年宗祖七百年御遠忌を奉修、記念事業に宗祖銅像建立、歴代の墓碑建立しました。玄関も新築し、昭和62年当山開創三百年を記念し明治以前の跡地に木造総桧造りの本堂を再建往年の姿を戻し、旧本堂は大改造して奥書院とし、鐘楼、表門を除く昔日の伽藍に復元し記念法要を奉修しました。

平成14年４月２８日日蓮大聖人立教開宗７５０年を記念し多宝塔「寂光殿」を建立し、法華経自我偈一千巻を納経し永代供養位牌堂並びに納骨供養堂になっています。

　　平成24年12月2日、大覚大僧正650遠忌・日隆大聖人550遠忌記念事業として鐘楼堂新築、梵鐘の新調、鬼子母神石像の建立、不動愛染明王の新調、多宝塔寂光殿の漆塗りなど創建当時の伽藍を復元しました。